Jogja merupakan salah satu kota yang susunan pemerintahannya di pimpin oleh seorang Raja dan merangkap sebagai gubernur. Jogja dikatakan istimewa karena pemilihan gubernur tidak di adakan. Raja yang memimpin keraton secara otomatis menjadi gubernur. tidak ada pilkada dan sangat berbeda dengan sistem pemilihan gubernur daerah lain. Selain itu gubernur bersifat turun-temurun dari keturunan kerajaan keraton Jogja, oleh karena itu Jogja disebut juga daerah yang Istimewa. Salah satu letak keistimewaan Jogja adalah nilai-nilai kemerdekaannya yang menyatu antara rakyat dan pemimpinnya.